念珠有其功德，好的念珠，功德可以增加很多 倍，不好的念珠，念一倍就是一倍。根据“数珠功德经”的记载是这样的：
铁者：五倍。
赤铜者：十倍。
真珠珊瑚者：百倍。
木木患子者：（又名“无木患子”，可能为桃李之核，因其有避邢之功用故也)。千倍。
莲子者：万倍。
帝释青子者；百万倍。（此物不明）
菩提子者：无数倍。
“摄真实经”中，则分念珠之功德为：
香木者：一分。
黄铜、铜铁 者：二分。
水晶、珍珠者：一分。
莲子、金刚子者：二分。
诸宝及菩提子者：无数分。
另外，如“瑜伽念诵经”、“守护国界经”、“苏悉地经”及“陀罗尼集经”等，对念珠之功德，均有记载。总而言之，所说都是以菩提子的功德最殊胜和最大，这是佛教中，无论出家在家，凡与佛有缘而喜修佛者，都喜欢使用菩提子念珠的原因。
但密宗修法或持咒，则有视法而用之说，唯凤眼菩提子念珠可以通用，但其他念珠，经加持后，也有以一当很多倍的功能。
所以，修持佛法的同道们，如要使用珠念（因念珠还有避邪、避煞的功用。）最好还是用菩提子，既可增加功德，又可助长道业也。
菩提子常见的有凤眼菩提、龙眼菩提和星月菩提3大类。元宝菩提属于星月菩提的一种。另菩提子并不是菩提树所结的果实，菩提树所结果实名叫金刚子。
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